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DNA: Evolu? dos processos de Seq^iamento e An?se
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Figura 4. Pyrosequencing
3.3.3. Sequenciamento do DNA por Hibridização.
A desvantagem desta técnica é o comprimento que pode ser seqüenciado por reação. Segundo BAPTISTA, (2003) a idéia central do método é a reconstrução de uma sequencia de DNA a partir do conjunto de todas as suas subseqüências de um determinado tamanho.
Um microarranjo comum contem 65.536 manchas, com oligonucleotídeos com oito mers, ou seja, nestas condições o tamanho Maximo de leitura para o seqüenciamento é de 256 pb.
A técnica de hibridização oligonucleotidica supera as limitações dos métodos convencionais (BAPTISTA, 2003). O sucesso desta técnica reside no desenvolvimento de um eficiente algoritmo, para a reconstrução da sequencia original de DNA a partir de subseqüências encontradas.
Um chip de DNA contendo um arranjo de diferentes nucleotídeos é utilizado, e a hibridização a um oligonucleotídeo qualquer adsorvido a placa indica a presença desta sequencia especifica em particular na molécula polinucleotídica pesquisada.
A analise da sequencia da molécula de DNA pesquisada é feita pela comparação entre todas as sequencias oligonucleotídicas a qual ocorreu hibridização. Daí a necessidade de um algoritmo eficiente.
4. Ferramentas de Análise
Existem hoje em dia, inúmeras ferramentas de análise de sequencias de DNA, que auxiliam nos processos…
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